Curso Bioinformatica Presencial

Descripción Curso Bioinformatica

El Curso Bioinformática es presencial, se imparte en Barcelona y tiene una duración de 50 horas.

INICIO DEL CURSO BIOINFORMÁTICA

7 de mayo de 2012

Temario Curso Bioinformatica

1. Introducción a la bioinformática (5h)

  - Intentando definir la bioinformática

  - Relevancia actual de la bioinformática

  - Formatos de ficheros y bases de datos

  - Proveedores institucionales de datos

  - Herramientas locales y de internet

2. Herramientas computacionales (24h)

  - Sistemas operativos alternativos: introducción a unix/linux

  - Órdenes en línea de comandos y filosofía de órdenes encadenadas (pipes)

  - Lenguajes de programación: Perl como ejemplo

  - Estructuras de datos, entrada/salida y funciones en Perl

  - Herramientas estadísticas: R como ejemplo

  - Librerías específicas de bioinformática: Bioconductor como ejemplo

  - Gestores de bases de datos: SQL como ejemplo

  - Detrás de las páginas web: HTML, Formularios, CGI, PHP, gestores de contenidos

3. Algoritmos (6h)

  - Búsqueda de patrones en secuencias

  - Alineamiento de secuencias: Dotplots y programación dinámica

  - Algoritmos heurísticos: FastA, BLAST y Clustal

4. Bioinformática aplicada (15h)

  - Análisis de secuencias genómicas (FastA y BLAST)

  - Más allá de BLAST: Prosite (búsqueda de patrones)

  - Transcriptómica (microarrays y qRT-PCR)

  - Minería en datos masivos (high throughput screening)

  - Biología de sistemas: Gene Ontology database (GO)

  - Análisis de la variación (polimorfismos)

  - Análisis de las relaciones evolutivas (filogenias)

  - Biología estructural tridimensional: PDB

Duración Curso Bioinformatica

DURACIÓN

50 horas

HORARIO

De lunes a viernes 18 a 21 h, excepto 7 de mayo de 18 a 20 h.